قسم مكافحة العدوى هو القسم المسؤول عن التحقيق و التقييم عن مدى سلامة بيئة المستشفى و خلوّها من الأوبئة من أجل صحّة المرضى و الموظفيين ، حيث يتّبع هذا القسم أسس المعرفة العلمية و الممارسة العمليّة و المتوافقة مع متطلّبات وزارة الصّحة و المجلس المركزي لإعتماد المنشئات الصحّية و المنفّذه لجميع أقسام و موظفيّي المستشفى.